Vol. 71 No. 1 (2024), Trabajos Libres XIV Congreso Colombiano de Alergia, Asma e Inmunología y el VI Encuentro de la Asociación Colombiana de Inmunología
Vol. 71 No. 1 (2024)

In silico analysis of Cit s 2: A highly conserved profilin

Trabajos Libres XIV Congreso Colombiano de Alergia, Asma e Inmunología y el VI Encuentro de la Asociación Colombiana de Inmunología
Published 2024-04-23 — Updated on 2025-03-20
Velky Ahumada
1. TECNNOSALUD Group, School of Health (ECISA). Universidad Nacional Abierta y a Distancia (UNAD). Cartagena de Indias, Colombia. 2. Grupo de Investigación de Tecnología Farmacéutica, Cosmética y de Alimentos. Universidad de Cartagena. Cartagena de Indias, Colombia
Nayelys Peña
Grupo de Investigación de Tecnología Farmacéutica, Cosmética y de Alimentos. Universidad de Cartagena. Cartagena de Indias, Colombia
Nestor Herrera
Grupo de Investigación de Tecnología Farmacéutica, Cosmética y de Alimentos. Universidad de Cartagena. Cartagena de Indias, Colombia
Juan Urrego
Universidad de Cartagena
−ACERCA DE LA PORTADA− El virus Epstein-Barr (EBV) es un gamma herpes virus que afecta humanos. La infección se adquiere principalmente durante la infancia o adolescencia; se presenta de manera asintomática o como un trastorno linfoproliferativo autolimitado que no requiere atención clínica. Sin embargo, afecta a más del 95% de la población adulta mundial y corresponde a uno de los virus oncogénicos más comunes en la especie humana: en promedio, cada año se asocia con 200,000 casos de cáncer. Interesantemente, solo un pequeño porcentaje de individuos infectados desarrolla procesos malignos, normalmente hospederos inmunocomprometidos o inmunodeficientes. EBV tiene un tropismo casi exclusivo por células B y de manera general la infección conduce a un estado latente o lítico, a partir de los cuales es posible desarrollar enfermedades y complicaciones. Las células citotóxicas NK y T CD8+ son los principales agentes inmunológicos que controlan y eliminan la infección por EBV. En este contexto, variantes genéticas que comprometan el desarrollo, proliferación, diferenciación, coestimulación y/o activación de células NK y T CD8+ predisponen al desarrollo de neoplasias o trastornos linfoproliferativos. Específicamente, se ha descrito la deficiencia, haploinsuficiencia o desregulación de ciertas proteínas citoplasmáticas, receptores de membrana, ligandos y transportadores de iones que afectan la función efectora de las células citotóxicas, y resultan en las secuelas más graves por EBV. Sin duda, el conocimiento ganado en este tema seguirá contribuyendo a diagnósticos más oportunos y el desarrollo de mejores estrategias terapéuticas en la clínica. Breve descripción de la portada: Dres. Arturo Gutiérrez Guerrero, Sara Elva Espinosa Padilla y Saúl Oswaldo Lugo Reyes.  Agradecimiento especial por la elaboración y diseño de la portada: DG. Diana Gabriela Salazar Rodríguez.
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Keywords

Allergen
Orange
Alignment
Profilins
Bioinformatic

Abstract

.

Objective: To analyze the phylogenetic relationships and molecular mimicry of Cit s 2 and other plant profilins.

Methods: Online bioinformatics tools, including BLASTP, PRALINE, and MEGA, were used for multiple alignments and phylogenetic analysis. A 3D homology model of Cit s 2 was predicted using MODELLER. The best model was selected based on the Maestro model scoring option. Conserved regions between Cit s 2 and other profilins were mapped onto the 3D model, and antigenic regions were predicted using the ElliPro server.

Results: The amino acid sequence of Cit s 2 (Uniprot code: P84177) was compared with 30 other profilins from different allergenic sources. The highest identity was observed with Cucumis melo (99%), followed by Prunus persica (98%) and Malus domestica (92%). Highly conserved antigenic regions were observed in the predicted 3D model. Seven linear epitopes and six discontinuous epitopes were identified in Cit s 2.

Conclusion: Highly conserved antigenic regions were observed in the predicted 3D model of Cit s 2, suggesting potential cross-reactivity between Cit s 2 and other profilins. Further studies are needed to analyze these findings in more detail.

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References

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